Το Ινστιτούτο διοικείται από Διοικητικό Συμβούλιο με Πρόεδρο τον Δρ. Α. Μεταξά και Αντιπρόεδρο τον Δρ. Μ. Κεκελέκη.
Για την καλύτερη οργανωτική στήριξη της λειτουργίας του Ινστιτούτου έχουν συσταθεί δύο Επιτροπές:
Η Συμβουλευτική Επιτροπή, στην οποία συμμετέχουν επιστήμονες του χώρου, με ιδιαίτερη εμβέλεια, επιστημονική και επαγγελματική φήμη και εμπειρία στο συγκεκριμένο χώρο. Ο ρόλος της Συμβουλευτικής Επιτροπής είναι η παροχή συμβουλευτικών κατευθύνσεων επί των δράσεων του Ινστιτούτου.
Η Ερευνητική Επιτροπή, στην οποία συμμετέχουν μέλη τα οποία ορίζονται με σχετική απόφαση του Διοικητικού Συμβουλίου, είναι αρμόδια για την υλοποίηση όλων των ερευνητικών, επιστημονικών και άλλων δράσεων του Ινστιτούτου. Την ερευνητική επιτροπή συντονίζουν ο Σταμάτης Δρακακάκης και Δρ. Γεώργιος Κολυβάς.
Ως μέλη του Ινστιτούτου μπορούν να εγγράφονται ενδιαφερόμενοι για το επιστημονικό αντικείμενο του Ινστιτούτου, ανεξαρτήτως της επιστημονικής τους εξειδίκευσης, σύμφωνα με τους ειδικότερους όρους του καταστατικού.
Συμβουλευτική Επιτροπή
Χρίστος Ανδρέου, Έφορος Κρατικών Ενισχύσεων στην Κύπρο
Αν. Καθ. Παναγιώτης Γρηγορίου, Πανεπιστήμιο Αιγαίου
Καθ. Γιάννης Κατσουλάκος, Αντιπρύτανης Οικονομικού Πανεπιστημίου Αθηνών
Καθ. Φαίδων Νικολαΐδης, Καθηγητής - Διευθυντής Σπουδών, Κολλέγιο της Ευρώπης
Καθ. Μιχάλης Τσινισιζέλης, Καθηγητής Πανεπιστημίου Αθηνών
Αν. Καθ. Κώστας Υφαντής, Πανεπιστήμιο Αθηνών
Αν. Καθ. Νικόλαος Φαραντούρης, Πανεπιστήμιο Πειραιά
Επικ. Καθ. Μαρία Παπαντώνη, Πάντειο Πανεπιστήμιο Αθηνών
Dr. Sc. Mirna Pavletic Zupic, Member of Croatian Competition Council, Croatia Competition Agency
Mag. iur. Valerie Ditz, LL.M. (London), Bundeswettbewerbsbehörde, Austria
Prof. Dr. Martin Nettesheim, University of Tuebingen, Law School
Prof. T. Tridimas, Sir John Lubbock Professor of Banking Law and Deputy Director of the Centre for Commercial Law Studies, Queen Mary University of London